Ahoj,
ad 2) Trošku jsem googlil, zdá se, že ten soubor geocaching_visits.txt obsahuje vše co jsem myslel - tedy kódy, datumy, časy. A GSAK s ním umí nativně pracovat, mrkni sem:
http://gsak.net/help/hs46070.htm
Já to teda nepoužívám, lovím mobilem (který je už starší a půjde letos nebo příští rok na upgrade) a co jsem ulovil si prostě nějak pořeším ručně. Není toho tolik v mém případě.
ad 3) Opravdu máš na mysli GPX se všemi keškami v oblasti? To nevím k čemu ti v případě exportu je. Při exportu se exportuje obsah databáze, nějaké GPX někde GSAK ani to makro vůbec nezajímá.
Prostě si v DB s těmi nenalezenými vyfiltruj body, které tě zajímají, zaškrtni v tom makru export filtru a zkus export.